Von den 13 220 ha Fläche sind 11 590 ha reine Meeresfläche, welche 1988 unter Schutz gestellt wurde. Das Karibische Meer stösst hier an die felsige Küste der Isla Bestimentos. Der Schutz von Meeresschildkröten ist hier ein besonderes Anliegen der Parkverwaltung. Auf der Südküste der Insel gibt es ruhige Strände mit Lagunen. Im Park findet man den grössten, karibischen Mangrovensumpf des Landes sowie gut konservierte Korallenriffe. Die durchschnittliche Jahrestemperatur liegt bei 26°C, die Niederschlagsmenge bei 3000 mm/J.

In den Mangrovenwäldern ist die weisse- und die rote Mangrove zu hause. Im Innern der Insel hat es dichten, tropischen Wald. Über 300 Pflanzensorten sind bislang gezählt worden, darunter Carapa guianensis, Manilkara zapota, Vochysia hondurensis, Tabebuia rosea und Terminalia amazonica.

Im Innern der Insel hat es Süsswasser mit Kaimanen, Spitzkrokodilen und Süsswasser Schildkröten. Im weiteren hat es 28 Amphibien und Reptiliensorten, von welchen nicht weniger als 17 gefährdet sind. Unter den 68 erforschten Vogelarten hat es einige Meeresvögel, wie den Fregattvogel. Die meisten jedoch leben im Innern der Wälder.

Im Nationalpark Marino Isla Bastimentos sind u.a. folgende Tierbeobachtungen möglich:

Faultier, Karettschildkröte, Nachtaffe, Amazonen, Fledermäuse